Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
LAMA2P24043 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
LAMA2P24043 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LAMA2P24043 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LAMA2P24043 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LAMA2P24043 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LAMA2P24043 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms