Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF3P20783 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF3P20783 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NTF3P20783 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NTF3P20783 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF3P20783 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF3P20783 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NTF3P20783 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF3P20783 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF3P20783 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NTF3P20783 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF3P20783 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF3P20783 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF3P20783 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF3P20783 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NTF3P20783 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NTF3P20783 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTF3P20783 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTF3P20783 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NTF3P20783 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NTF3P20783 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTF3P20783 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTF3P20783 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NTF3P20783 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTF3P20783 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTF3P20783 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NTF3P20783 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTF3P20783 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NTF3P20783 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NTF3P20783 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF3P20783 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF3P20783 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF3P20783 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NTF3P20783 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF3P20783 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF3P20783 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF3P20783 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NTF3P20783 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NTF3P20783 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NTF3P20783 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF3P20783 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF3P20783 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NTF3P20783 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF3P20783 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF3P20783 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NTF3P20783 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTF3P20783 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTF3P20783 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTF3P20783 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTF3P20783 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NTF3P20783 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTF3P20783 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTF3P20783 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NTF3P20783 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTF3P20783 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTF3P20783 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NTF3P20783 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NTF3P20783 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NTF3P20783 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NTF3P20783 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms