Protein–RNA interactions for Protein: P18848

ATF4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF4P18848 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ATF4P18848 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ATF4P18848 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF4P18848 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF4P18848 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF4P18848 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF4P18848 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF4P18848 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ATF4P18848 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF4P18848 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF4P18848 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF4P18848 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF4P18848 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ATF4P18848 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATF4P18848 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ATF4P18848 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATF4P18848 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATF4P18848 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATF4P18848 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ATF4P18848 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ATF4P18848 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATF4P18848 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATF4P18848 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATF4P18848 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATF4P18848 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATF4P18848 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATF4P18848 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATF4P18848 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATF4P18848 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATF4P18848 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATF4P18848 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATF4P18848 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATF4P18848 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATF4P18848 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATF4P18848 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ATF4P18848 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATF4P18848 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ATF4P18848 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATF4P18848 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATF4P18848 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATF4P18848 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ATF4P18848 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATF4P18848 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATF4P18848 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATF4P18848 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATF4P18848 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATF4P18848 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ATF4P18848 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ATF4P18848 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATF4P18848 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATF4P18848 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATF4P18848 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATF4P18848 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATF4P18848 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATF4P18848 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATF4P18848 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATF4P18848 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATF4P18848 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATF4P18848 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATF4P18848 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATF4P18848 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms