Protein–RNA interactions for Protein: P16442

ABO, Histo-blood group ABO system transferase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABOP16442 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABOP16442 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABOP16442 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABOP16442 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABOP16442 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABOP16442 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ABOP16442 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABOP16442 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ABOP16442 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABOP16442 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABOP16442 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABOP16442 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ABOP16442 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABOP16442 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABOP16442 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABOP16442 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABOP16442 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABOP16442 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ABOP16442 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABOP16442 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABOP16442 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABOP16442 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ABOP16442 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABOP16442 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABOP16442 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABOP16442 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ABOP16442 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABOP16442 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABOP16442 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABOP16442 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ABOP16442 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ABOP16442 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABOP16442 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABOP16442 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABOP16442 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABOP16442 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ABOP16442 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABOP16442 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABOP16442 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABOP16442 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABOP16442 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ABOP16442 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ABOP16442 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABOP16442 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABOP16442 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABOP16442 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ABOP16442 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABOP16442 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABOP16442 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ABOP16442 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABOP16442 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABOP16442 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABOP16442 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABOP16442 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ABOP16442 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABOP16442 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABOP16442 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ABOP16442 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABOP16442 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABOP16442 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ABOP16442 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABOP16442 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ABOP16442 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABOP16442 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABOP16442 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABOP16442 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABOP16442 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABOP16442 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ABOP16442 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABOP16442 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABOP16442 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ABOP16442 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABOP16442 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ABOP16442 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ABOP16442 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABOP16442 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABOP16442 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ABOP16442 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ABOP16442 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABOP16442 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ABOP16442 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABOP16442 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABOP16442 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABOP16442 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ABOP16442 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABOP16442 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABOP16442 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABOP16442 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABOP16442 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ABOP16442 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ABOP16442 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABOP16442 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ABOP16442 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms