Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VAV1P15498 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VAV1P15498 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV1P15498 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV1P15498 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VAV1P15498 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV1P15498 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV1P15498 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VAV1P15498 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VAV1P15498 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAV1P15498 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAV1P15498 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAV1P15498 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VAV1P15498 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV1P15498 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV1P15498 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VAV1P15498 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV1P15498 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV1P15498 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VAV1P15498 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV1P15498 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
VAV1P15498 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV1P15498 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV1P15498 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VAV1P15498 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV1P15498 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV1P15498 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
VAV1P15498 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV1P15498 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV1P15498 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV1P15498 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VAV1P15498 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV1P15498 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV1P15498 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV1P15498 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV1P15498 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
VAV1P15498 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV1P15498 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV1P15498 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV1P15498 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV1P15498 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV1P15498 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
VAV1P15498 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV1P15498 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV1P15498 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV1P15498 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VAV1P15498 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
VAV1P15498 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV1P15498 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VAV1P15498 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV1P15498 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
VAV1P15498 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV1P15498 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV1P15498 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV1P15498 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV1P15498 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
VAV1P15498 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
VAV1P15498 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VAV1P15498 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VAV1P15498 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV1P15498 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV1P15498 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
VAV1P15498 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
VAV1P15498 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV1P15498 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV1P15498 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV1P15498 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
VAV1P15498 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAV1P15498 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VAV1P15498 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV1P15498 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV1P15498 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV1P15498 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV1P15498 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
VAV1P15498 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV1P15498 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV1P15498 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV1P15498 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV1P15498 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV1P15498 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
VAV1P15498 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV1P15498 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV1P15498 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
VAV1P15498 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VAV1P15498 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms