Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT13P13646 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT13P13646 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT13P13646 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT13P13646 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
KRT13P13646 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
KRT13P13646 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT13P13646 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT13P13646 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KRT13P13646 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
KRT13P13646 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
KRT13P13646 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT13P13646 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
KRT13P13646 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT13P13646 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT13P13646 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT13P13646 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT13P13646 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KRT13P13646 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT13P13646 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT13P13646 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
KRT13P13646 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT13P13646 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KRT13P13646 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT13P13646 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT13P13646 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
KRT13P13646 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KRT13P13646 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KRT13P13646 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT13P13646 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT13P13646 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT13P13646 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT13P13646 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
KRT13P13646 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT13P13646 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT13P13646 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KRT13P13646 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT13P13646 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT13P13646 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT13P13646 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT13P13646 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KRT13P13646 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT13P13646 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT13P13646 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT13P13646 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KRT13P13646 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT13P13646 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT13P13646 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KRT13P13646 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT13P13646 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT13P13646 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT13P13646 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KRT13P13646 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT13P13646 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KRT13P13646 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT13P13646 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT13P13646 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT13P13646 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT13P13646 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT13P13646 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KRT13P13646 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KRT13P13646 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT13P13646 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KRT13P13646 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT13P13646 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT13P13646 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KRT13P13646 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms