Protein–RNA interactions for Protein: P12319

FCER1A, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCER1AP12319 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FCER1AP12319 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
FCER1AP12319 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
FCER1AP12319 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
FCER1AP12319 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
FCER1AP12319 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
FCER1AP12319 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
FCER1AP12319 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
FCER1AP12319 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
FCER1AP12319 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms