Protein–RNA interactions for Protein: P11473

VDR, Vitamin D3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VDRP11473 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VDRP11473 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VDRP11473 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VDRP11473 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
VDRP11473 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VDRP11473 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VDRP11473 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VDRP11473 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VDRP11473 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VDRP11473 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VDRP11473 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VDRP11473 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VDRP11473 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VDRP11473 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VDRP11473 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VDRP11473 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VDRP11473 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VDRP11473 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VDRP11473 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VDRP11473 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VDRP11473 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.96
VDRP11473 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VDRP11473 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VDRP11473 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
VDRP11473 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VDRP11473 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VDRP11473 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VDRP11473 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VDRP11473 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VDRP11473 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VDRP11473 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VDRP11473 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VDRP11473 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
VDRP11473 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
VDRP11473 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VDRP11473 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VDRP11473 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VDRP11473 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VDRP11473 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VDRP11473 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
VDRP11473 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VDRP11473 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
VDRP11473 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VDRP11473 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VDRP11473 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VDRP11473 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VDRP11473 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
VDRP11473 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VDRP11473 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
VDRP11473 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VDRP11473 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VDRP11473 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VDRP11473 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
VDRP11473 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VDRP11473 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VDRP11473 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VDRP11473 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VDRP11473 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VDRP11473 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
VDRP11473 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VDRP11473 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VDRP11473 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VDRP11473 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VDRP11473 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VDRP11473 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
VDRP11473 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VDRP11473 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VDRP11473 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
VDRP11473 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
VDRP11473 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VDRP11473 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
VDRP11473 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
VDRP11473 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VDRP11473 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
VDRP11473 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
VDRP11473 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VDRP11473 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VDRP11473 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms