Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMIGD3P0DMS9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMIGD3P0DMS9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMIGD3P0DMS9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMIGD3P0DMS9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMIGD3P0DMS9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms