Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETSIPP0DME0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETSIPP0DME0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SETSIPP0DME0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SETSIPP0DME0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SETSIPP0DME0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SETSIPP0DME0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SETSIPP0DME0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SETSIPP0DME0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SETSIPP0DME0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms