Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
RGPD1P0DJD0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.79■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
RGPD1P0DJD0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
RGPD1P0DJD0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
RGPD1P0DJD0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
RGPD1P0DJD0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
RGPD1P0DJD0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC34.48■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
RGPD1P0DJD0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms