Protein–RNA interactions for Protein: P04179

SOD2, Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD2P04179 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SOD2P04179 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOD2P04179 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SOD2P04179 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SOD2P04179 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOD2P04179 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOD2P04179 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOD2P04179 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SOD2P04179 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
SOD2P04179 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOD2P04179 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOD2P04179 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SOD2P04179 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SOD2P04179 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SOD2P04179 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOD2P04179 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
SOD2P04179 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SOD2P04179 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOD2P04179 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOD2P04179 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SOD2P04179 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
SOD2P04179 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOD2P04179 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOD2P04179 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOD2P04179 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SOD2P04179 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
SOD2P04179 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
SOD2P04179 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SOD2P04179 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOD2P04179 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOD2P04179 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOD2P04179 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SOD2P04179 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
SOD2P04179 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
SOD2P04179 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOD2P04179 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOD2P04179 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SOD2P04179 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SOD2P04179 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SOD2P04179 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOD2P04179 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOD2P04179 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOD2P04179 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SOD2P04179 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SOD2P04179 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOD2P04179 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOD2P04179 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOD2P04179 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOD2P04179 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SOD2P04179 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SOD2P04179 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOD2P04179 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOD2P04179 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SOD2P04179 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOD2P04179 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOD2P04179 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SOD2P04179 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOD2P04179 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOD2P04179 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOD2P04179 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SOD2P04179 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOD2P04179 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOD2P04179 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SOD2P04179 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOD2P04179 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOD2P04179 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOD2P04179 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SOD2P04179 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SOD2P04179 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SOD2P04179 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOD2P04179 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOD2P04179 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SOD2P04179 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOD2P04179 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOD2P04179 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOD2P04179 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SOD2P04179 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SOD2P04179 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOD2P04179 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SOD2P04179 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SOD2P04179 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOD2P04179 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SOD2P04179 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOD2P04179 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOD2P04179 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SOD2P04179 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms