Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SEC24AO95486 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SEC24AO95486 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SEC24AO95486 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SEC24AO95486 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SEC24AO95486 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms