Protein–RNA interactions for Protein: O94988

FAM13A, Protein FAM13A, humanhuman

Predictions only

Length 1,023 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM13AO94988 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
FAM13AO94988 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
FAM13AO94988 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM13AO94988 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM13AO94988 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM13AO94988 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms