Protein–RNA interactions for Protein: O94913

PCF11, Pre-mRNA cleavage complex 2 protein Pcf11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCF11O94913 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC40.74■■■■■ 4.11
PCF11O94913 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PCF11O94913 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
PCF11O94913 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
PCF11O94913 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
PCF11O94913 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC40.72■■■■■ 4.11
PCF11O94913 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PCF11O94913 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC40.72■■■■■ 4.11
PCF11O94913 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
PCF11O94913 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
PCF11O94913 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
PCF11O94913 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
PCF11O94913 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
PCF11O94913 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PCF11O94913 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
PCF11O94913 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PCF11O94913 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
PCF11O94913 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PCF11O94913 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PCF11O94913 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PCF11O94913 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
PCF11O94913 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCF11O94913 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCF11O94913 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
PCF11O94913 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
PCF11O94913 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PCF11O94913 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PCF11O94913 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PCF11O94913 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
PCF11O94913 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
PCF11O94913 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
PCF11O94913 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
PCF11O94913 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCF11O94913 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCF11O94913 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCF11O94913 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCF11O94913 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
PCF11O94913 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
PCF11O94913 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PCF11O94913 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PCF11O94913 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
PCF11O94913 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
PCF11O94913 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
PCF11O94913 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
PCF11O94913 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PCF11O94913 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
PCF11O94913 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PCF11O94913 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC40.55■■■■■ 4.08
PCF11O94913 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
PCF11O94913 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PCF11O94913 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
PCF11O94913 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
PCF11O94913 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PCF11O94913 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PCF11O94913 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
PCF11O94913 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
PCF11O94913 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
PCF11O94913 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
PCF11O94913 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PCF11O94913 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
PCF11O94913 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
PCF11O94913 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
PCF11O94913 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.07
PCF11O94913 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
PCF11O94913 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
PCF11O94913 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PCF11O94913 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
PCF11O94913 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
PCF11O94913 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
PCF11O94913 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCF11O94913 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCF11O94913 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCF11O94913 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCF11O94913 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
PCF11O94913 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCF11O94913 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
PCF11O94913 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
PCF11O94913 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PCF11O94913 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PCF11O94913 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
PCF11O94913 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC40.44■■■■■ 4.06
PCF11O94913 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.43■■■■■ 4.06
PCF11O94913 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PCF11O94913 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
PCF11O94913 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PCF11O94913 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PCF11O94913 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PCF11O94913 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
PCF11O94913 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PCF11O94913 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PCF11O94913 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
PCF11O94913 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
PCF11O94913 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PCF11O94913 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.4■■■■■ 4.06
PCF11O94913 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
PCF11O94913 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PCF11O94913 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PCF11O94913 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PCF11O94913 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
PCF11O94913 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms