Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF6O94906 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRPF6O94906 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRPF6O94906 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PRPF6O94906 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PRPF6O94906 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms