Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOO75962 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOO75962 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOO75962 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOO75962 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIOO75962 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOO75962 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOO75962 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIOO75962 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOO75962 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOO75962 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIOO75962 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOO75962 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOO75962 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOO75962 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRIOO75962 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRIOO75962 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIOO75962 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRIOO75962 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIOO75962 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRIOO75962 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRIOO75962 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIOO75962 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRIOO75962 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRIOO75962 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIOO75962 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIOO75962 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRIOO75962 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIOO75962 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRIOO75962 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIOO75962 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIOO75962 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIOO75962 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIOO75962 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIOO75962 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIOO75962 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIOO75962 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIOO75962 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIOO75962 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIOO75962 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIOO75962 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIOO75962 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIOO75962 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIOO75962 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIOO75962 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIOO75962 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIOO75962 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIOO75962 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIOO75962 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIOO75962 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIOO75962 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIOO75962 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIOO75962 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIOO75962 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIOO75962 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIOO75962 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIOO75962 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIOO75962 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIOO75962 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIOO75962 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIOO75962 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIOO75962 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIOO75962 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIOO75962 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIOO75962 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIOO75962 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIOO75962 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIOO75962 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIOO75962 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIOO75962 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIOO75962 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIOO75962 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIOO75962 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIOO75962 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIOO75962 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIOO75962 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIOO75962 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIOO75962 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIOO75962 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIOO75962 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIOO75962 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIOO75962 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIOO75962 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIOO75962 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 315.7 ms