Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABBR2O75899 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR2O75899 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR2O75899 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GABBR2O75899 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms