Protein–RNA interactions for Protein: O75581

LRP6, Low-density lipoprotein receptor-related protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP6O75581 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
LRP6O75581 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP6O75581 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP6O75581 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP6O75581 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
LRP6O75581 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRP6O75581 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRP6O75581 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRP6O75581 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
LRP6O75581 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRP6O75581 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
LRP6O75581 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
LRP6O75581 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRP6O75581 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRP6O75581 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRP6O75581 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
LRP6O75581 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP6O75581 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP6O75581 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP6O75581 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
LRP6O75581 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
LRP6O75581 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRP6O75581 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
LRP6O75581 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRP6O75581 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
LRP6O75581 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRP6O75581 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
LRP6O75581 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
LRP6O75581 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRP6O75581 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.44■■■■□ 3.26
LRP6O75581 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRP6O75581 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRP6O75581 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
LRP6O75581 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRP6O75581 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRP6O75581 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
LRP6O75581 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
LRP6O75581 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
LRP6O75581 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
LRP6O75581 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRP6O75581 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
LRP6O75581 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRP6O75581 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRP6O75581 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
LRP6O75581 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRP6O75581 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
LRP6O75581 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRP6O75581 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
LRP6O75581 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
LRP6O75581 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
LRP6O75581 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
LRP6O75581 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRP6O75581 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRP6O75581 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
LRP6O75581 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
LRP6O75581 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
LRP6O75581 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
LRP6O75581 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
LRP6O75581 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRP6O75581 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRP6O75581 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
LRP6O75581 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
LRP6O75581 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
LRP6O75581 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
LRP6O75581 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
LRP6O75581 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
LRP6O75581 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRP6O75581 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
LRP6O75581 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP6O75581 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP6O75581 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP6O75581 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP6O75581 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP6O75581 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
LRP6O75581 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRP6O75581 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
LRP6O75581 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRP6O75581 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRP6O75581 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRP6O75581 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
LRP6O75581 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
LRP6O75581 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC35.2■■■■□ 3.23
LRP6O75581 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRP6O75581 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRP6O75581 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRP6O75581 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
LRP6O75581 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
LRP6O75581 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRP6O75581 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
LRP6O75581 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP6O75581 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP6O75581 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP6O75581 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP6O75581 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
LRP6O75581 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP6O75581 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP6O75581 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP6O75581 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP6O75581 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
LRP6O75581 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms