Protein–RNA interactions for Protein: O60673

REV3L, DNA polymerase zeta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 3,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REV3LO60673 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.56■■■□□ 2
REV3LO60673 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
REV3LO60673 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REV3LO60673 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
REV3LO60673 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
REV3LO60673 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
REV3LO60673 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
REV3LO60673 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.54■■■□□ 2
REV3LO60673 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
REV3LO60673 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REV3LO60673 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
REV3LO60673 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REV3LO60673 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
REV3LO60673 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
REV3LO60673 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
REV3LO60673 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
REV3LO60673 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
REV3LO60673 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
REV3LO60673 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REV3LO60673 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
REV3LO60673 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
REV3LO60673 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REV3LO60673 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REV3LO60673 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REV3LO60673 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
REV3LO60673 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REV3LO60673 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
REV3LO60673 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
REV3LO60673 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REV3LO60673 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
REV3LO60673 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REV3LO60673 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
REV3LO60673 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REV3LO60673 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REV3LO60673 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
REV3LO60673 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
REV3LO60673 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REV3LO60673 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REV3LO60673 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
REV3LO60673 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
REV3LO60673 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
REV3LO60673 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
REV3LO60673 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
REV3LO60673 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
REV3LO60673 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
REV3LO60673 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
REV3LO60673 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
REV3LO60673 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REV3LO60673 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
REV3LO60673 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REV3LO60673 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
REV3LO60673 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
REV3LO60673 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
REV3LO60673 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
REV3LO60673 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
REV3LO60673 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
REV3LO60673 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
REV3LO60673 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
REV3LO60673 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
REV3LO60673 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REV3LO60673 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REV3LO60673 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REV3LO60673 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
REV3LO60673 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
REV3LO60673 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REV3LO60673 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REV3LO60673 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REV3LO60673 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
REV3LO60673 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
REV3LO60673 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
REV3LO60673 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
REV3LO60673 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
REV3LO60673 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
REV3LO60673 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
REV3LO60673 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
REV3LO60673 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
REV3LO60673 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REV3LO60673 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REV3LO60673 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
REV3LO60673 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
REV3LO60673 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
REV3LO60673 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
REV3LO60673 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
REV3LO60673 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
REV3LO60673 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
REV3LO60673 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REV3LO60673 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
REV3LO60673 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
REV3LO60673 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REV3LO60673 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
REV3LO60673 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
REV3LO60673 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms