Protein–RNA interactions for Protein: O60287

URB1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB1O60287 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
URB1O60287 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
URB1O60287 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
URB1O60287 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
URB1O60287 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
URB1O60287 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
URB1O60287 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
URB1O60287 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
URB1O60287 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
URB1O60287 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
URB1O60287 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
URB1O60287 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
URB1O60287 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
URB1O60287 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
URB1O60287 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
URB1O60287 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
URB1O60287 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
URB1O60287 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
URB1O60287 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
URB1O60287 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
URB1O60287 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
URB1O60287 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
URB1O60287 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
URB1O60287 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
URB1O60287 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
URB1O60287 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
URB1O60287 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
URB1O60287 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
URB1O60287 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URB1O60287 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URB1O60287 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URB1O60287 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
URB1O60287 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
URB1O60287 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
URB1O60287 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
URB1O60287 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
URB1O60287 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
URB1O60287 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
URB1O60287 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
URB1O60287 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
URB1O60287 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
URB1O60287 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
URB1O60287 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
URB1O60287 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
URB1O60287 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
URB1O60287 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
URB1O60287 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
URB1O60287 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
URB1O60287 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
URB1O60287 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
URB1O60287 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
URB1O60287 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
URB1O60287 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
URB1O60287 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
URB1O60287 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
URB1O60287 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
URB1O60287 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
URB1O60287 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
URB1O60287 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
URB1O60287 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
URB1O60287 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
URB1O60287 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
URB1O60287 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
URB1O60287 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
URB1O60287 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
URB1O60287 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
URB1O60287 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
URB1O60287 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
URB1O60287 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
URB1O60287 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
URB1O60287 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
URB1O60287 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
URB1O60287 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
URB1O60287 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
URB1O60287 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
URB1O60287 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
URB1O60287 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
URB1O60287 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
URB1O60287 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
URB1O60287 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
URB1O60287 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
URB1O60287 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
URB1O60287 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
URB1O60287 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
URB1O60287 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
URB1O60287 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
URB1O60287 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
URB1O60287 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
URB1O60287 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
URB1O60287 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
URB1O60287 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
URB1O60287 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
URB1O60287 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms