Protein–RNA interactions for Protein: O60243

HS6ST1, Heparan-sulfate 6-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS6ST1O60243 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
HS6ST1O60243 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HS6ST1O60243 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HS6ST1O60243 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HS6ST1O60243 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms