Protein–RNA interactions for Protein: O43918

AIRE, Autoimmune regulator, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIREO43918 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AIREO43918 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIREO43918 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIREO43918 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AIREO43918 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AIREO43918 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AIREO43918 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AIREO43918 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIREO43918 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIREO43918 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIREO43918 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIREO43918 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AIREO43918 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIREO43918 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AIREO43918 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AIREO43918 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIREO43918 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIREO43918 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AIREO43918 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
AIREO43918 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIREO43918 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIREO43918 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIREO43918 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIREO43918 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
AIREO43918 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
AIREO43918 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
AIREO43918 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
AIREO43918 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIREO43918 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIREO43918 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
AIREO43918 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIREO43918 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIREO43918 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIREO43918 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
AIREO43918 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
AIREO43918 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIREO43918 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIREO43918 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIREO43918 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIREO43918 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIREO43918 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
AIREO43918 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
AIREO43918 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
AIREO43918 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
AIREO43918 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIREO43918 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIREO43918 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIREO43918 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
AIREO43918 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIREO43918 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIREO43918 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIREO43918 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIREO43918 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AIREO43918 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AIREO43918 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIREO43918 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AIREO43918 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AIREO43918 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIREO43918 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIREO43918 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIREO43918 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIREO43918 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AIREO43918 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AIREO43918 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIREO43918 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AIREO43918 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIREO43918 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIREO43918 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIREO43918 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AIREO43918 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIREO43918 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AIREO43918 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIREO43918 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AIREO43918 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms