Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
EXTL3O43909 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
EXTL3O43909 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXTL3O43909 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EXTL3O43909 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EXTL3O43909 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms