Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SGTAO43765 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SGTAO43765 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SGTAO43765 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGTAO43765 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGTAO43765 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SGTAO43765 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGTAO43765 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SGTAO43765 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGTAO43765 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGTAO43765 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGTAO43765 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGTAO43765 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGTAO43765 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SGTAO43765 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SGTAO43765 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SGTAO43765 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGTAO43765 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGTAO43765 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGTAO43765 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SGTAO43765 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SGTAO43765 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGTAO43765 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGTAO43765 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SGTAO43765 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGTAO43765 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGTAO43765 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SGTAO43765 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGTAO43765 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGTAO43765 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGTAO43765 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SGTAO43765 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGTAO43765 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGTAO43765 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGTAO43765 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGTAO43765 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SGTAO43765 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGTAO43765 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGTAO43765 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGTAO43765 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SGTAO43765 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGTAO43765 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGTAO43765 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGTAO43765 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGTAO43765 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGTAO43765 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGTAO43765 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGTAO43765 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGTAO43765 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGTAO43765 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGTAO43765 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGTAO43765 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGTAO43765 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGTAO43765 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGTAO43765 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGTAO43765 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGTAO43765 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGTAO43765 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGTAO43765 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGTAO43765 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGTAO43765 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGTAO43765 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGTAO43765 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms