Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RNF13O43567 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RNF13O43567 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RNF13O43567 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF13O43567 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RNF13O43567 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF13O43567 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF13O43567 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RNF13O43567 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF13O43567 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF13O43567 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RNF13O43567 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF13O43567 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF13O43567 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF13O43567 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF13O43567 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RNF13O43567 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF13O43567 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF13O43567 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF13O43567 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF13O43567 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF13O43567 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RNF13O43567 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF13O43567 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF13O43567 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF13O43567 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RNF13O43567 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF13O43567 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF13O43567 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RNF13O43567 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF13O43567 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RNF13O43567 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF13O43567 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF13O43567 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF13O43567 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RNF13O43567 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RNF13O43567 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RNF13O43567 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF13O43567 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF13O43567 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RNF13O43567 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF13O43567 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF13O43567 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF13O43567 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RNF13O43567 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF13O43567 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RNF13O43567 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF13O43567 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF13O43567 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF13O43567 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF13O43567 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF13O43567 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RNF13O43567 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF13O43567 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF13O43567 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF13O43567 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF13O43567 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF13O43567 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RNF13O43567 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF13O43567 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF13O43567 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF13O43567 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF13O43567 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RNF13O43567 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF13O43567 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF13O43567 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF13O43567 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF13O43567 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RNF13O43567 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RNF13O43567 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1295.2 ms