Protein–RNA interactions for Protein: O15499

GSC2, Homeobox protein goosecoid-2, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2O15499 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSC2O15499 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GSC2O15499 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSC2O15499 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSC2O15499 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSC2O15499 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSC2O15499 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSC2O15499 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GSC2O15499 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSC2O15499 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GSC2O15499 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSC2O15499 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GSC2O15499 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSC2O15499 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GSC2O15499 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GSC2O15499 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GSC2O15499 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSC2O15499 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSC2O15499 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSC2O15499 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSC2O15499 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GSC2O15499 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSC2O15499 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSC2O15499 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
GSC2O15499 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSC2O15499 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSC2O15499 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
GSC2O15499 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSC2O15499 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSC2O15499 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GSC2O15499 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSC2O15499 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSC2O15499 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSC2O15499 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GSC2O15499 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSC2O15499 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSC2O15499 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSC2O15499 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSC2O15499 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
GSC2O15499 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSC2O15499 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSC2O15499 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSC2O15499 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GSC2O15499 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
GSC2O15499 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSC2O15499 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSC2O15499 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
GSC2O15499 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSC2O15499 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
GSC2O15499 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSC2O15499 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSC2O15499 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GSC2O15499 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GSC2O15499 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSC2O15499 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GSC2O15499 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSC2O15499 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSC2O15499 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GSC2O15499 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GSC2O15499 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSC2O15499 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GSC2O15499 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GSC2O15499 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSC2O15499 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GSC2O15499 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSC2O15499 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GSC2O15499 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSC2O15499 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSC2O15499 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSC2O15499 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GSC2O15499 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSC2O15499 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GSC2O15499 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GSC2O15499 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSC2O15499 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSC2O15499 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GSC2O15499 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSC2O15499 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GSC2O15499 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
GSC2O15499 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSC2O15499 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSC2O15499 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GSC2O15499 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSC2O15499 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GSC2O15499 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSC2O15499 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GSC2O15499 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GSC2O15499 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 215.1 ms