Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLGNO14967 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLGNO14967 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLGNO14967 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CLGNO14967 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLGNO14967 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLGNO14967 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLGNO14967 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLGNO14967 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CLGNO14967 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CLGNO14967 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLGNO14967 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLGNO14967 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLGNO14967 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLGNO14967 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLGNO14967 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLGNO14967 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CLGNO14967 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLGNO14967 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLGNO14967 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CLGNO14967 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLGNO14967 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLGNO14967 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLGNO14967 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLGNO14967 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLGNO14967 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLGNO14967 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLGNO14967 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLGNO14967 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CLGNO14967 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLGNO14967 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLGNO14967 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLGNO14967 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLGNO14967 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLGNO14967 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLGNO14967 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLGNO14967 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CLGNO14967 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLGNO14967 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLGNO14967 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLGNO14967 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLGNO14967 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CLGNO14967 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CLGNO14967 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLGNO14967 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLGNO14967 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLGNO14967 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLGNO14967 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CLGNO14967 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLGNO14967 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLGNO14967 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLGNO14967 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CLGNO14967 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLGNO14967 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLGNO14967 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLGNO14967 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CLGNO14967 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CLGNO14967 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms