Protein–RNA interactions for Protein: H7BZ55

CROCC2, Putative ciliary rootlet coiled-coil protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROCC2H7BZ55 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC38.97■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.97■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
CROCC2H7BZ55 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.94■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC38.93■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.92■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.91■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.9■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
CROCC2H7BZ55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC38.88■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.84■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
CROCC2H7BZ55 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
CROCC2H7BZ55 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.75■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.73■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.71■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
CROCC2H7BZ55 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.66■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC38.64■■■■□ 3.78
CROCC2H7BZ55 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC38.63■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC38.61■■■■□ 3.77
CROCC2H7BZ55 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms