Protein–RNA interactions for Protein: H3BNX3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNX3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H3BNX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BNX3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BNX3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H3BNX3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H3BNX3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNX3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNX3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNX3 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H3BNX3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNX3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNX3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
H3BNX3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H3BNX3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNX3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H3BNX3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNX3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNX3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNX3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNX3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
H3BNX3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
H3BNX3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNX3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNX3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
H3BNX3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNX3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNX3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
H3BNX3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNX3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNX3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNX3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
H3BNX3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNX3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
H3BNX3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNX3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNX3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H3BNX3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNX3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNX3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNX3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNX3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H3BNX3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNX3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
H3BNX3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
H3BNX3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BNX3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H3BNX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNX3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNX3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H3BNX3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNX3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNX3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNX3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNX3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H3BNX3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNX3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
H3BNX3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNX3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNX3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNX3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNX3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNX3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H3BNX3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
H3BNX3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H3BNX3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
H3BNX3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNX3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
H3BNX3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNX3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNX3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNX3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNX3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
H3BNX3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNX3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNX3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNX3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNX3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H3BNX3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNX3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNX3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNX3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H3BNX3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms