Protein–RNA interactions for Protein: C9JVI0

USP17L11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L11C9JVI0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
USP17L11C9JVI0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
USP17L11C9JVI0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
USP17L11C9JVI0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
USP17L11C9JVI0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
USP17L11C9JVI0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
USP17L11C9JVI0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms