Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
C4orf47A7E2U8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C4orf47A7E2U8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C4orf47A7E2U8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
C4orf47A7E2U8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C4orf47A7E2U8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms