Protein–RNA interactions for Protein: A6NJY4

Putative transmembrane protein LOC100289255, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NJY4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NJY4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NJY4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
A6NJY4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NJY4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NJY4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
A6NJY4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NJY4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NJY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NJY4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NJY4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
A6NJY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
A6NJY4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NJY4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
A6NJY4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
A6NJY4 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NJY4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NJY4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NJY4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NJY4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
A6NJY4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A6NJY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
A6NJY4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
A6NJY4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NJY4 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NJY4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NJY4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NJY4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NJY4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
A6NJY4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
A6NJY4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
A6NJY4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
A6NJY4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NJY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NJY4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NJY4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NJY4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
A6NJY4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NJY4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NJY4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NJY4 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
A6NJY4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NJY4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NJY4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NJY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NJY4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
A6NJY4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NJY4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NJY4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NJY4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NJY4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NJY4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
A6NJY4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NJY4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NJY4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
A6NJY4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
A6NJY4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
A6NJY4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NJY4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NJY4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NJY4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NJY4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NJY4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
A6NJY4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NJY4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
A6NJY4 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NJY4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NJY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NJY4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NJY4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
A6NJY4 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NJY4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
A6NJY4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
A6NJY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms