Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EPOPA6NHQ4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
EPOPA6NHQ4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
EPOPA6NHQ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
EPOPA6NHQ4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.56■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.56■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.54■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.53■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
EPOPA6NHQ4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
EPOPA6NHQ4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms