Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRABD2BA6NFA1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TRABD2BA6NFA1 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRABD2BA6NFA1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRABD2BA6NFA1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRABD2BA6NFA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms