Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
XIRP2A4UGR9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
XIRP2A4UGR9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
XIRP2A4UGR9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
XIRP2A4UGR9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
XIRP2A4UGR9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms