Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLX4-201ENST00000294008 7307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKT1-208ENST00000554581 3916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ALS2CL-201ENST00000318962 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL6A3-203ENST00000353578 9963 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 NAA40-202ENST00000377793 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AURKA-204ENST00000395907 1902 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RORB-202ENST00000396204 2996 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP1G2-202ENST00000397120 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGCR2-205ENST00000537045 4361 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 VPS11-208ENST00000621676 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF286A-203ENST00000421016 5541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 OPTN-202ENST00000378747 3400 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ELP3-219ENST00000537665 3053 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 LVRN-201ENST00000357872 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTGES3L-AARSD1-203ENST00000409399 2042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC243772.2-201ENST00000428289 3543 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RHOBTB1-202ENST00000357917 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PASK-202ENST00000358649 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 EDARADD-204ENST00000637660 2803 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 MELK-201ENST00000298048 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAPN9-202ENST00000354537 2484 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK11IP-204ENST00000456909 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIPK2-201ENST00000342645 2937 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRM4-202ENST00000374181 7275 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 MFN2-201ENST00000235329 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF155-201ENST00000270014 2596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 GPR17-206ENST00000544369 2598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PAFAH1B2-204ENST00000527958 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC073578.3-201ENST00000624926 4191 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 NLRP1-208ENST00000571451 5444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTCH1-208ENST00000430669 8232 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNAS-214ENST00000371100 4029 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 HPS1-204ENST00000361490 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC142384.1-201ENST00000566346 1549 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF91-201ENST00000300619 5489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPP-AS2-201ENST00000605573 2852 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEPT2-206ENST00000402092 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PHKA1-203ENST00000373542 6020 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 C3orf14-206ENST00000494481 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZSCAN22-201ENST00000329665 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSDE1-205ENST00000438362 4167 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX6-210ENST00000528252 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKAR1A-217ENST00000589228 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMARCAL1-201ENST00000357276 3271 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CST4-201ENST00000217423 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSPG4P1Y-201ENST00000306641 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSPG4P2Y-201ENST00000306853 795 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP178-201ENST00000365005 329 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNA5SP19-201ENST00000365186 109 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 FLAD1-204ENST00000368428 1111 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHV1-2-201ENST00000390594 417 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 GRPEL2P2-201ENST00000421856 670 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL512590.1-201ENST00000430691 821 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 ACTG1P21-201ENST00000431536 1000 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 MRPL52-205ENST00000432849 411 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL357992.1-201ENST00000433442 130 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031597.1-201ENST00000447383 432 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL353615.1-201ENST00000450850 390 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090955.1-201ENST00000458338 235 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL734P-201ENST00000460858 298 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020978.1-201ENST00000465542 337 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL210P-201ENST00000484688 288 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP003551.1-201ENST00000495884 574 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.4 ms