Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SNORA81.2-201ENST00000516868 170 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01572-205ENST00000570152 360 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC004862.1-203ENST00000598433 1020 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ALS2CR12-201ENST00000286190 1769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC007000.3-201ENST00000459742 617 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AL592148.2-201ENST00000612210 372 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
GTF2H3Q13889 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms