Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC073288.1-201ENST00000466291 469 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC010343.2-201ENST00000510162 224 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC009120.3-201ENST00000563335 499 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC009054.1-201ENST00000568140 427 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC008914.1-201ENST00000576302 797 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 FAM27E2-201ENST00000619668 403 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC026124.2-201ENST00000621847 656 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 IFIT1-202ENST00000546318 4613 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MYO3B-203ENST00000409044 5448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF578-201ENST00000421239 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ARCN1-202ENST00000359415 4038 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC125793.1-201ENST00000565238 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 OR6C3-202ENST00000641364 1341 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 GTDC1-201ENST00000241391 2356 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 EFNA5-206ENST00000611503 4933 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RN7SKP275-201ENST00000364626 301 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNU6-253P-201ENST00000384730 105 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 RN7SKP144-201ENST00000411108 279 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
FHL3Q13643 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms