Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC106788.2-201ENST00000610646 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AL390037.1-201ENST00000610918 431 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC244255.1-201ENST00000613463 398 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HIST1H4D-201ENST00000614247 312 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC009053.4-201ENST00000614366 108 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC138904.2-201ENST00000614412 107 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CBR3-AS1-218ENST00000625189 517 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 SNORA17B-202ENST00000626886 136 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ARHGAP17-201ENST00000289968 3461 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 CUL4A-212ENST00000617546 5666 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 MCM6-201ENST00000264156 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 TPTE-201ENST00000427445 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 VPS11-206ENST00000614944 3388 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TRIM53BP-201ENST00000532912 1720 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZEB2-201ENST00000303660 3913 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 TRMO-207ENST00000611338 3635 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 NAP1L3-202ENST00000475430 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MRAS-210ENST00000614350 4377 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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HOXD11P31277 LINC01258-201ENST00000512517 2059 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ZNF345-202ENST00000420450 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HLA-DOA-201ENST00000229829 3489 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CORO2A-201ENST00000343933 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 AC118344.2-201ENST00000622968 4765 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 CCR4-201ENST00000330953 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HSD17B4-220ENST00000513628 2225 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 HERC2P3-206ENST00000429257 4088 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 ST8SIA3-201ENST00000324000 11833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
HOXD11P31277 MAMDC2-AS1-204ENST00000448377 1923 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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