Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLCN5-203ENST00000376091 3046 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC13A2-202ENST00000444914 2855 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 YY1AP1-209ENST00000368330 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SRD5A1-201ENST00000274192 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPEB4-207ENST00000519835 2257 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DENND2A-209ENST00000496613 3562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ANKRD46-206ENST00000520552 1686 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 GABRA5-201ENST00000335625 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 STRIP1-202ENST00000369796 3125 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009690.2-201ENST00000570175 3148 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005696.4-201ENST00000614400 3147 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX28-204ENST00000619903 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL008638.6-201ENST00000623947 4254 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABR-201ENST00000291107 2673 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIVEP1-201ENST00000379388 9027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIVEP1-208ENST00000541134 9023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTIF2-201ENST00000263629 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NID2-201ENST00000216286 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SH3BGRL2-201ENST00000369838 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RASAL1-201ENST00000261729 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDK15-203ENST00000434439 2240 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CPT1B-207ENST00000457250 2217 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADD1-210ENST00000503455 3206 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PKP2-201ENST00000070846 4241 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXJ3-201ENST00000361346 5225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAB6A-202ENST00000336083 3085 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TBC1D3P5-203ENST00000586223 3083 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIFAB-201ENST00000537858 5923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ITIH1-201ENST00000273283 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM153B-201ENST00000253490 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF627-204ENST00000588174 2755 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ABL2-211ENST00000512653 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF4BP5-201ENST00000567338 1795 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ECM2-204ENST00000444490 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LCMT1-AS2-201ENST00000562280 2601 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PRKAG2-201ENST00000287878 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTPRN-204ENST00000423636 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TLR3-202ENST00000504367 2310 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZDHHC9-201ENST00000357166 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF558-201ENST00000301475 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PEX5L-208ENST00000467460 9082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC12A6-207ENST00000558667 3725 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTC27-201ENST00000317907 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIRREL1-201ENST00000359209 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAVER1-201ENST00000293677 3595 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CYB5B-201ENST00000307892 4286 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DIRAS1-201ENST00000323469 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL031590.1-203ENST00000642075 2747 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 NRXN3-217ENST00000634499 6069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHPF2-201ENST00000035307 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SOX30-201ENST00000265007 3265 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 C15orf39-201ENST00000360639 4517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAGE2-203ENST00000496773 2598 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009163.7-201ENST00000621929 2557 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SLC4A5-204ENST00000377634 3814 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DCT-201ENST00000377028 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF266-206ENST00000592292 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF540-210ENST00000592533 3147 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL160006.1-201ENST00000554749 4216 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 EXOC7-216ENST00000589210 4751 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 CUX1-221ENST00000622516 2990 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 E2F8-205ENST00000620009 3519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 LACC1-201ENST00000325686 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PGA3-201ENST00000325558 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AAGAB-201ENST00000261880 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPECC1-204ENST00000395527 3363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007608.4-201ENST00000623140 3365 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF331-201ENST00000253144 5042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX2-204ENST00000583097 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 TEX2-210ENST00000615733 4852 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 SARDH-207ENST00000439388 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF438-206ENST00000442986 3245 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGKA-229ENST00000551156 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 ADAM1A-201ENST00000424240 2129 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 RGS7BP-201ENST00000334025 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.3 ms