Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 PLSCR2-207ENST00000613069 1208 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
TTPAP49638 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
TTPAP49638 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
TTPAP49638 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 FOXP2-217ENST00000462331 1388 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 NMNAT1P2-201ENST00000435192 860 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
TTPAP49638 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.2 ms