Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AFG3L2Q9Y4W6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AFG3L2Q9Y4W6 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms