Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2U9

KLHDC2, Kelch domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC2Q9Y2U9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KLHDC2Q9Y2U9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms