Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y261

FOXA2, Hepatocyte nuclear factor 3-beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXA2Q9Y261 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
FOXA2Q9Y261 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
FOXA2Q9Y261 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms