Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HPS5Q9UPZ3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HPS5Q9UPZ3 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms