Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
IGSF9BQ9UPX0 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms