Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PARP4Q9UKK3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PARP4Q9UKK3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms