Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CDC42EP3Q9UKI2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms