Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
USP21Q9UK80 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
USP21Q9UK80 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms